Ein Therapieprotokoll wird dann in mehreren Zyklen und bestimmten Zeitabständen verabreicht. Auch Varianten der Protokolle oder verschiedene Protokolle werden zu einem umfangreichen Gesamtprotokoll zusammengefasst. Jede Klinik, Praxis oder jeder onkologische Anwender muss selbst die Protokollinformationen aus wissenschaftlichen Publikationen oder Protokollverzeichnissen in konkrete Verordnungen überführen. Dies geschah bisher handschriftlich, mit Protokollvordrucken, elektronischen Arbeitsblättern oder elektronischen Verordnungssystemen.
Das Fraunhofer IESE hat in Zusammenarbeit mit den onkologischen Fachärzten und Apothekern der Onkodin GmbH Protokolle zur medikamentösen Chemotherapie standardisiert und formal beschrieben, sodass sie elektronisch erstellt und verarbeitet werden können. Die dabei verfolgte Grundidee ist, dass jedes Protokoll aus in sich abgeschlossenen Bausteinen zusammengesetzt ist, die normiert definiert werden können. Dazu zählen die Angaben von Substanzen, Erkrankungen, Art der Applikation, Literaturangaben, Supportivtherapie u. v. a. Einzelne Bausteine lassen sich zu komplexeren Modulen arrangieren, die in einer relationalen Datenbank verwaltet werden. Durch den modularen Aufbau können Protokolle bei Bedarf, wie beispielsweise Dosisänderungen, leicht modifiziert und aktualisiert werden. Für den digitalen Export werden die Therapieprotokolle jeweils dynamisch aus den Datenbankinhalten generiert und über vorhandene Schnittstellen in die gewünschte klinische bzw. ärztliche Anwendung strukturiert exportiert.
Hierfür gibt es verschiedene Optionen wie die Online-PDF-Darstellung und für die Therapie den Export in eine MS-Excel-Anwendung, den Export in die Programme BD CatoTM, J-MED und Omniplaner. Für die schnelle Information über die Therapie steht eine einfachere Variante unter der Website www.onchemo.com sowohl für Desktop als auch mobile Endgeräte frei zur Verfügung. Bis Januar 2024 wurden insgesamt 2475 Therapieprotokolle in deutscher und englischer Sprache auf der Basis wissenschaftlicher Originalpublikationen bereitgestellt. Diese Protokolle, die gemäß den onkologischen Leitlinien erstellt wurden, werden kontinuierlich ergänzt und von vielen niedergelassenen Onkologen, Kliniken und Apotheken genutzt. Eine eigens vom Fraunhofer IESE entwickelte Redaktionsplattform unterstützt die Experten bei der leitliniengerechten Erstellung bzw. Aktualisierung einzelner Protokolle und einer regelmäßig durch Hämatologen-Onkologen und Pharmazeuten vorgenommen Qualitätskontrolle.